Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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