Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTF1Q16619 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CTF1Q16619 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CTF1Q16619 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CTF1Q16619 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CTF1Q16619 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CTF1Q16619 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CTF1Q16619 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTF1Q16619 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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