Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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SGCBQ16585 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SGCBQ16585 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SGCBQ16585 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SGCBQ16585 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SGCBQ16585 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SGCBQ16585 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SGCBQ16585 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SGCBQ16585 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SGCBQ16585 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SGCBQ16585 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SGCBQ16585 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SGCBQ16585 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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