Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SNAPC1Q16533 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SNAPC1Q16533 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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SNAPC1Q16533 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SNAPC1Q16533 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SNAPC1Q16533 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SNAPC1Q16533 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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