Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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