Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF4Q15306 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF4Q15306 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms