Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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RAB39AQ14964 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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RAB39AQ14964 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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RAB39AQ14964 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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RAB39AQ14964 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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RAB39AQ14964 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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RAB39AQ14964 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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RAB39AQ14964 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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RAB39AQ14964 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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