Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IKBKEQ14164 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IKBKEQ14164 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IKBKEQ14164 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IKBKEQ14164 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IKBKEQ14164 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IKBKEQ14164 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IKBKEQ14164 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IKBKEQ14164 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IKBKEQ14164 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IKBKEQ14164 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IKBKEQ14164 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IKBKEQ14164 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IKBKEQ14164 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IKBKEQ14164 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IKBKEQ14164 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms