Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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ITGA9Q13797 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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ITGA9Q13797 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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ITGA9Q13797 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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ITGA9Q13797 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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ITGA9Q13797 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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ITGA9Q13797 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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ITGA9Q13797 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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ITGA9Q13797 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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ITGA9Q13797 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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