Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms