Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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CUL4AQ13619 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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CUL4AQ13619 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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CUL4AQ13619 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
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CUL4AQ13619 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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CUL4AQ13619 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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