Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DNASE1L3Q13609 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms