Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA5AQ13591 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA5AQ13591 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms