Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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SGCGQ13326 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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SGCGQ13326 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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SGCGQ13326 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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SGCGQ13326 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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SGCGQ13326 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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SGCGQ13326 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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SGCGQ13326 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SGCGQ13326 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SGCGQ13326 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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SGCGQ13326 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCGQ13326 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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