Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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NR1H3Q13133 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
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NR1H3Q13133 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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