Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLFQ13129 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLFQ13129 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLFQ13129 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLFQ13129 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLFQ13129 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLFQ13129 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLFQ13129 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLFQ13129 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLFQ13129 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLFQ13129 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLFQ13129 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLFQ13129 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLFQ13129 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLFQ13129 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLFQ13129 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLFQ13129 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLFQ13129 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLFQ13129 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLFQ13129 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLFQ13129 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLFQ13129 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLFQ13129 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLFQ13129 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLFQ13129 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLFQ13129 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLFQ13129 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RLFQ13129 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLFQ13129 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLFQ13129 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLFQ13129 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLFQ13129 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLFQ13129 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLFQ13129 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLFQ13129 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms