Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
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