Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC10A2Q12908 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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