Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ELP6Q0PNE2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms