Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC15Q0P6D6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms