Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms