Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms