Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms