Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms