Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms