Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms