Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms