Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKOR1P84550 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms