Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SH3BP2P78314 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2P78314 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms