Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPP1CAP62136 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms