Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VBP1P61758 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VBP1P61758 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VBP1P61758 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VBP1P61758 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VBP1P61758 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VBP1P61758 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VBP1P61758 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VBP1P61758 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VBP1P61758 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VBP1P61758 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VBP1P61758 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VBP1P61758 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VBP1P61758 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VBP1P61758 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VBP1P61758 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VBP1P61758 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VBP1P61758 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VBP1P61758 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VBP1P61758 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VBP1P61758 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VBP1P61758 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VBP1P61758 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VBP1P61758 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VBP1P61758 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VBP1P61758 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VBP1P61758 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VBP1P61758 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VBP1P61758 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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VBP1P61758 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VBP1P61758 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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VBP1P61758 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VBP1P61758 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VBP1P61758 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VBP1P61758 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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VBP1P61758 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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VBP1P61758 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VBP1P61758 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VBP1P61758 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VBP1P61758 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VBP1P61758 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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