Protein–RNA interactions for Protein: P58294

PROK1, Prokineticin-1, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK1P58294 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PROK1P58294 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PROK1P58294 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PROK1P58294 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PROK1P58294 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PROK1P58294 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PROK1P58294 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PROK1P58294 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PROK1P58294 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PROK1P58294 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PROK1P58294 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PROK1P58294 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PROK1P58294 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PROK1P58294 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PROK1P58294 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PROK1P58294 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PROK1P58294 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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