Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms