Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC13P55735 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC13P55735 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC13P55735 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC13P55735 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC13P55735 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC13P55735 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC13P55735 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC13P55735 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC13P55735 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC13P55735 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC13P55735 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC13P55735 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC13P55735 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC13P55735 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC13P55735 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC13P55735 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC13P55735 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC13P55735 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC13P55735 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC13P55735 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC13P55735 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC13P55735 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC13P55735 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC13P55735 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC13P55735 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC13P55735 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC13P55735 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC13P55735 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC13P55735 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC13P55735 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC13P55735 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC13P55735 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC13P55735 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC13P55735 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC13P55735 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC13P55735 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC13P55735 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC13P55735 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC13P55735 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC13P55735 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC13P55735 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC13P55735 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC13P55735 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC13P55735 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC13P55735 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC13P55735 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC13P55735 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC13P55735 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms