Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDF10P55107 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDF10P55107 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDF10P55107 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDF10P55107 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDF10P55107 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDF10P55107 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDF10P55107 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDF10P55107 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDF10P55107 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDF10P55107 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDF10P55107 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDF10P55107 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDF10P55107 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDF10P55107 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDF10P55107 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDF10P55107 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GDF10P55107 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDF10P55107 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GDF10P55107 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDF10P55107 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDF10P55107 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDF10P55107 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDF10P55107 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDF10P55107 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDF10P55107 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDF10P55107 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDF10P55107 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDF10P55107 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDF10P55107 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GDF10P55107 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDF10P55107 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GDF10P55107 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDF10P55107 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDF10P55107 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDF10P55107 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDF10P55107 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDF10P55107 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDF10P55107 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDF10P55107 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDF10P55107 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDF10P55107 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDF10P55107 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GDF10P55107 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GDF10P55107 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GDF10P55107 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GDF10P55107 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GDF10P55107 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GDF10P55107 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GDF10P55107 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GDF10P55107 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF10P55107 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF10P55107 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF10P55107 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF10P55107 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF10P55107 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF10P55107 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GDF10P55107 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms