Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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PGGT1BP53609 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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PGGT1BP53609 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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PGGT1BP53609 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP53609 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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