Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2A1P52655 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms