Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC3P51654 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC3P51654 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC3P51654 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC3P51654 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC3P51654 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC3P51654 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC3P51654 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC3P51654 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC3P51654 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC3P51654 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC3P51654 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC3P51654 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC3P51654 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC3P51654 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC3P51654 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC3P51654 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC3P51654 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC3P51654 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC3P51654 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC3P51654 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC3P51654 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC3P51654 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC3P51654 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GPC3P51654 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC3P51654 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC3P51654 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC3P51654 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC3P51654 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC3P51654 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC3P51654 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC3P51654 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC3P51654 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC3P51654 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC3P51654 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC3P51654 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC3P51654 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC3P51654 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC3P51654 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC3P51654 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC3P51654 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC3P51654 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC3P51654 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC3P51654 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC3P51654 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC3P51654 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC3P51654 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC3P51654 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC3P51654 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC3P51654 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC3P51654 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GPC3P51654 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GPC3P51654 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GPC3P51654 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GPC3P51654 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GPC3P51654 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
GPC3P51654 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPC3P51654 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPC3P51654 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPC3P51654 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPC3P51654 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPC3P51654 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms