Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms