Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA4P48169 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms