Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSFMP43897 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSFMP43897 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSFMP43897 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSFMP43897 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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