Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PIK3CBP42338 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms