Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MLH1P40692 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MLH1P40692 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MLH1P40692 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MLH1P40692 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MLH1P40692 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MLH1P40692 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MLH1P40692 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MLH1P40692 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MLH1P40692 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MLH1P40692 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MLH1P40692 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MLH1P40692 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MLH1P40692 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MLH1P40692 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MLH1P40692 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MLH1P40692 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MLH1P40692 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MLH1P40692 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MLH1P40692 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MLH1P40692 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MLH1P40692 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MLH1P40692 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MLH1P40692 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MLH1P40692 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MLH1P40692 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MLH1P40692 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MLH1P40692 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MLH1P40692 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MLH1P40692 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MLH1P40692 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MLH1P40692 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MLH1P40692 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MLH1P40692 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MLH1P40692 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MLH1P40692 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MLH1P40692 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MLH1P40692 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MLH1P40692 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MLH1P40692 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MLH1P40692 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MLH1P40692 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MLH1P40692 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MLH1P40692 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MLH1P40692 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MLH1P40692 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MLH1P40692 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MLH1P40692 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MLH1P40692 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MLH1P40692 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MLH1P40692 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MLH1P40692 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MLH1P40692 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MLH1P40692 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MLH1P40692 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MLH1P40692 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MLH1P40692 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MLH1P40692 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MLH1P40692 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MLH1P40692 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MLH1P40692 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MLH1P40692 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MLH1P40692 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MLH1P40692 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MLH1P40692 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms