Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GGCXP38435 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GGCXP38435 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GGCXP38435 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GGCXP38435 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GGCXP38435 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GGCXP38435 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GGCXP38435 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GGCXP38435 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GGCXP38435 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GGCXP38435 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GGCXP38435 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GGCXP38435 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GGCXP38435 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GGCXP38435 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GGCXP38435 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GGCXP38435 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GGCXP38435 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GGCXP38435 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGCXP38435 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGCXP38435 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms