Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FLT4P35916 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FLT4P35916 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FLT4P35916 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FLT4P35916 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FLT4P35916 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FLT4P35916 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FLT4P35916 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT4P35916 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT4P35916 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT4P35916 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT4P35916 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT4P35916 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT4P35916 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT4P35916 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT4P35916 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT4P35916 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT4P35916 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT4P35916 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT4P35916 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT4P35916 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT4P35916 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT4P35916 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT4P35916 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FLT4P35916 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms