Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLD1P28340 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD1P28340 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD1P28340 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD1P28340 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD1P28340 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD1P28340 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD1P28340 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD1P28340 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD1P28340 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD1P28340 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD1P28340 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD1P28340 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD1P28340 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD1P28340 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD1P28340 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD1P28340 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD1P28340 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD1P28340 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD1P28340 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD1P28340 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD1P28340 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD1P28340 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD1P28340 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD1P28340 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD1P28340 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLD1P28340 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms