Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PSMB9P28065 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PSMB9P28065 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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PSMB9P28065 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PSMB9P28065 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PSMB9P28065 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PSMB9P28065 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PSMB9P28065 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PSMB9P28065 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB9P28065 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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