Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LMO1P25800 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LMO1P25800 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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LMO1P25800 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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