Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO2P25791 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO2P25791 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LMO2P25791 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LMO2P25791 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LMO2P25791 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
LMO2P25791 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LMO2P25791 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LMO2P25791 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms