Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPREP23469 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPREP23469 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPREP23469 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPREP23469 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPREP23469 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPREP23469 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPREP23469 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPREP23469 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPREP23469 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPREP23469 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPREP23469 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPREP23469 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPREP23469 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPREP23469 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPREP23469 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPREP23469 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPREP23469 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPREP23469 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPREP23469 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPREP23469 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPREP23469 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPREP23469 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPREP23469 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPREP23469 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPREP23469 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPREP23469 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPREP23469 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPREP23469 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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